Hi Markus,
das ist normal, dass Unterseiten meist einen kleineren oder gar keinen PR haben. Denn schließlich verlinken die meisten Backlinks auf deine Startseite und nur sehr wenige auf eine Unterseite. Von der Startseite aus hast du aber Links zu den einzelnen Modulen, Galerie etc., von dort aus wird dein Startseiten-PR etwas vererbt.
Hast du jetzt auf der Startseite einen PR3 und noch 20 weitere Links auf der Startseite, dann bekommen die Unterseiten keinen PR3, sondern müssen den mit 20 weiteren Unterseiten teilen. Demnach fällt der sehr viel kleiner aus. Unterseiten die noch gar keinen Backlink haben, werden spätestens nach dem nächsten PR Update einen PR0 oder höher kriegen. So ein PR Update lässt meist 3-4 Monate auf sich warten.
Zu deine Unterseiten für Links:
Google erkennt mittlerweile sehr gut, dass Links im Footer oder auf speziellen Linkseiten, unter Partner etc. nur für SEO-Absichten genutzt werden und ignoriert diese zwar noch nicht, straft sie aber ab. Sie werden also bei weitem nicht so hoch angerechnet wie normale Links aus dem Content heraus.
Viele wissen das auch schon und wollen bei einem Linktausch auch gar nicht mehr auf so eine Linkseite, sondern lieber irgendwo in den Content. Angenommen du hast einen Artikel über das Oktoberfest und willst mit einer anderen Oktoberfest-Seite einen Linktausch betreiben, dann wäre es sinnvoller den Link im Artikel unterzubringen, als auf einer Linkseite wo noch zig andere Links stehen. Da ist auch der PR nicht so wichtig. Die themenrelevanten Links werden in Zukunft auch immer wichtiger werden.
Und zu den Webkatalogen. Ich hab vor einiger Zeit auch immer gelesen und gedacht, dass Webkatalogeinträge gut sind und mir einen höheren PR erwirtschaften. Sagen wir mal so, sie sind zwar nicht wirklich schlecht aber auch nicht wirklich profitabel. So ein Link aus einem normalen Webkatalog bringt dir nur sehr wenig und man sollte halt abwegen ob sich der Aufwand dafür lohnt. Wie gesagt jeder Backlink bringt ein wenig was, manch einer mehr und manch einer fast gar nichts. Die Webkataloge halt so gut wie gar nichts. Es gibt aber auch Webkataloge, die bei Google und Co. recht gut angesehen werden. Dazu zählen z.b. dmoz, allesklar und yahoo. Also ich würde mir nicht mehr so viel Mühe mit Webkatalogen machen.
Deine Unterseiten würden dann auch einen PR bekommen, wenn du sie z.b. von der Startseite aus verlinken würdest, dann würden die auch ein wenig was vererbt bekommen. Bringen tut es deinen Linkpartnern aber wie gesagt nicht viel. Wenn sie sowas aber in Ordnung finden, kannst es ja trotzdem machen

Und dass deine Module und Unterseiten keinen PR haben, liegt einfach daran dass auf deiner Startseite sehr viele interne Links sind. Derzeit hast du da 249 interne Links und die teilen sich alle den PR3. Davon bleibt dann nicht so viel übrig. Du musst halt gucken, dass du deine wichtigen Module mit weiteren Links versorgen kannst.
Gruß, Manu